1)කුඩා අණු පෙප්ටයිඩයඅවශෝෂණය කර ගැනීම පහසු වන අතර ප්රතිවිරෝධියක් නොමැත

2) කුඩා අණු පෙප්ටයිඩවල ශක්තිමත් ජෛව ක්රියාකාරකම් සහ පුළුල් පරාසයක ක්රියාකාරී ක්රියා

3) කුඩා අණු පෙප්ටයිඩ ව්යුහය වෙනස් කිරීම සහ නැවත සම්බන්ධ කිරීම පහසුය

4) කුඩා අණු පෙප්ටයිඩ වැඩිදියුණු කිරීම සිදු නොකරයි

5) කුඩා අරුකීය පෙප්ටයිඩවල අවශෝෂණය හා පරිවෘත්තීය අනුපාතය නොමිලේ ඇමයිනෝ අම්ල වලට වඩා වේගවත් ය

6) කුඩා අණු පෙප්ටයිඩ සහ ඇමයිනෝ අම්ලවල අවශෝෂණ යාන්ත්රණය සම්පූර්ණයෙන්ම වෙනස් ය

7) මිනිස් සිරුරට ඇමයිනෝ අම්ල වලට වඩා කුඩා පෙප්ටයිඩ වර්ග අවශෝෂණය කර භාවිතා කළ හැකිය

8) කුඩා අණු පෙප්ටයිඩ වල භෞතික විද්යාත්මක කාර්යයන් ඇමයිනෝ අම්ල වලට දරාගත නොහැකිය